基于化学位移和伪氨基酸组分信息预测抗凋亡蛋白质与促凋亡蛋白质

凋亡蛋白质是一种有着特殊功能的蛋白质,在生物体的生长和维持体内平衡中扮演着重要的角色.在细胞凋亡过程中抗与促凋亡蛋白质对细胞凋亡的调控起着不同的作用.如果抗凋亡蛋白质或者促凋亡蛋白质失活,将导致癌症和其它疾病的发生,所以对抗凋亡蛋白质和促凋亡蛋白质的识别,将有助于更好的了解凋亡蛋白的致病机理.建立一个新的凋亡蛋白质数据集,并基于化学位移信息和伪氨基酸组分信息采用支持向量机(SVM)方法对新的数据集进行了预测.融合后的特征信息用Jackknife检验预测成功率达到77.01%,从预测结果可以看出提取有效的特征信息是提高预测成功率的重要因素.

国家自然科学基金(No.61361015); 教育部科学技术研究重点项目(No.212023); 教育部第46批留学回国人员科研启动基金; 内蒙古自治区自然科学基金(No.2012MS0104);

抗凋亡蛋白质; 促凋亡蛋白质; 化学位移; 伪氨基酸组分信息; 支持向量机;

10.13484/j.nmgdxxbzk.20140208

Q51

73158-1647155K
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